Die Saison 2019/2020 war zunächst geprägt von der Freude über die Gründung des FC Blue Stars Frauen 1968 am 16. September 2019. Nach Abschluss der Vorbereitungsarbeiten hatten Männer und Frauen des FC Blue Stars entscchieden, dass die ehemalige Frauensektion sich in einem eigenen Verein als FC Blue Stars Zürich Frauen 1968 organisieren sollte. Die einvernehmliche Trennung hatte zur Folge, dass die Frauenabteilung beim Schweizerischen Fussballverband und beim Regionalverband Zürich weiterhin in den angestammten Ligen geführt wurde. Sportlich führte der Schwung das Fanion-Team auf den guten 5. Platz in der Vorrunde der 1. Liga. Voller Zuversicht bestritt das Team das Trainingslager in San Pedro de Pinatar in Spanien. Wegen der Corona-Massnahmen wurden dann die Rückrunde abgesagt und die Meisterschaft nicht gewertet. Bei allen Teams war die Enttäuschung darüber gross, denn auch das Frauen 2 und die Juniorinnen-Teams hatten sich für die Frühjahrsrunde viel vorgenommen.
